Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CC2D1BQ5T0F9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms