Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNT1Q5JUK3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNT1Q5JUK3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms