Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAN3Q58A45 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms