Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6CQ53S08 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms