Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms