Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4L6Q3SYB3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms