Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTLL9Q3SXZ7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms