Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms