Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TWISTNBQ3B726 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms