Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIF1AQ16665 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms