Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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