Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP7Q16576 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms