Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZIC1Q15915 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms