Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYTH1Q15438 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYTH1Q15438 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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