Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms