Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCOLCEQ15113 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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