Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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BRD3Q15059 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRD3Q15059 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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