Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRS1Q15050 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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