Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ERV3-1Q14264 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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ERV3-1Q14264 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ERV3-1Q14264 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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ERV3-1Q14264 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERV3-1Q14264 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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