Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNC3Q14003 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC3Q14003 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms