Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCINQ13939 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCINQ13939 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CCINQ13939 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCINQ13939 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCINQ13939 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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