Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX3Q13761 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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