Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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