Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN4PQ13434 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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