Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms