Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF5Q13243 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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