Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2BQ13224 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2BQ13224 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
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