Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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ACACAQ13085 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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