Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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GTF3C1Q12789 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3C1Q12789 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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