Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCRN3Q0VDG4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms