Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK18Q07002 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK18Q07002 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms