Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms