Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FANCCQ00597 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms