Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms