Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2BQ00403 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms