Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPCAP84074 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms