Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX6P78412 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRX6P78412 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms