Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms