Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTBP60709 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms