Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK4P57078 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms