Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC13P55735 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC13P55735 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC13P55735 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC13P55735 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms