Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFDNP55196 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFDNP55196 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFDNP55196 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFDNP55196 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFDNP55196 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFDNP55196 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFDNP55196 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms