Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TAF6P49848 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms