Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTDSS1P48651 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms