Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP3P42574 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP3P42574 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms