Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGCXP38435 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GGCXP38435 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GGCXP38435 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGCXP38435 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms