Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBP1P32455 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBP1P32455 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBP1P32455 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBP1P32455 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms