Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5DP30049 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms