Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms