Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4AP27815 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms